Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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USF2Q15853 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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USF2Q15853 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USF2Q15853 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USF2Q15853 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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