Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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VAMP3Q15836 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
VAMP3Q15836 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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