Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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