Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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