Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC1A5Q15758 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms