Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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