Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms