Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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