Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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