Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms