Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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ITGA9Q13797 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA9Q13797 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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