Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA3CQ13748 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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