Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1SQ13698 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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