Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGCGQ13326 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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