Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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