Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIK2Q13002 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIK2Q13002 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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