Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSTF3Q12996 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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