Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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NPRL3Q12980 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NPRL3Q12980 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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