Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTP4A2Q12974 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms