Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms