Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNA1Q09470 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms