Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF4Q08170 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms