Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOX4Q06945 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms