Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FMODQ06828 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FMODQ06828 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FMODQ06828 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms