Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITIH3Q06033 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITIH3Q06033 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms