Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP7AQ04656 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP7AQ04656 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms