Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPCQ03188 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms