Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNFRSF17Q02223 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms