Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms