Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF9Q00978 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms