Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTCQ00610 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms