Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX6P78412 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IRX6P78412 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX6P78412 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX6P78412 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX6P78412 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX6P78412 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms