Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP2P78314 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms