Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTA1P68133 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms