Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB15P59190 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB15P59190 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB15P59190 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB15P59190 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB15P59190 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB15P59190 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms