Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EEFSECP57772 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms