Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GSCP56915 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSCP56915 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSCP56915 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSCP56915 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSCP56915 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms