Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC13P55735 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC13P55735 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC13P55735 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC13P55735 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms