Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms