Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP12AP54707 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms