Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMARCA4P51532 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMARCA4P51532 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms