Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF6P49848 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF6P49848 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF6P49848 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF6P49848 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF6P49848 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF6P49848 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms