Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSK3BP49841 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms