Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACTR1BP42025 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms