Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPGP40121 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CAPGP40121 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPGP40121 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPGP40121 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPGP40121 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms