Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJC1P36383 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJC1P36383 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJC1P36383 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms