Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BMI1P35226 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms