Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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CASQ1P31415 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASQ1P31415 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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