Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD10P28358 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms