Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms